Cirkonij je kao element prvi prepoznao Martin Heinrich Klaproth 1789. godine u Berlinu, u uzorku cirkona iz Šri Lanke. Metal cirkonij prvi je dobio u nečistom obliku Jöns Jakob Berzelius godine 1824. zagrijavanjem smjese kalija i kalijeva cirkonij-fluorida u željeznoj cijevi. Nizozemski znanstvenici Anton Eduard van Arkel i Jan Hendrik de Boer otkrili su metodu proizvodnje cirkonija visoke čistoće 1925.
O Zircónio foi identificado como elemento, pela primeira vez, por Martin Heinrich Klaproth, em 1789, em Berlim, numa amostra de zircão, proveniente do Sri Lanka. O metal Zircónio foi obtido, pela primeira vez, em forma impura, por Jöns Jakob Berzelius, em 1824, pelo aquecimento de uma mistura de potássio e fluoreto de potássio e zircónio, num tubo de de ferro. Os cientistas holandeses Anton Eduard van Arkel e Jan Hendrik de Boer descobriram um método para produzir Zircónio de elevado grau de pureza, em 1925.